瓯海区卫生监督所位于温州市将军桥兴海路39号。瓯海区卫生监督所现有工作人员35人，科室设置为办公室、法制稽查科、卫生监督科、职业卫生监督科、初审科、办证科、梧田分所、三溪分所。

2000年9月份进行卫生体制改革，合并原瓯海区卫生防疫站和妇幼保健站，分别组建瓯海区卫生监督所和瓯海区疾病预防控制中心，为隶属瓯海区卫生局的全民事业单位。

  区卫生监督所受卫生局委托行使卫生监督执法职能，承担着依法监督管理食品、化妆品、消毒产品、生活饮用水及涉及饮用水卫生安全产品；依法监督管理公共场所、职业、放射、学校卫生等工作；依法监督传染病防治、医疗机构和采供血机构及其执业人员的执业活动，整顿和规范医疗服务市场，打击非法行医和非法采供血行为等一线监督执法任务。